Video: Bagaimana contigs dirakit menjadi perancah?
2024 Pengarang: Miles Stephen | [email protected]. Terakhir diubah: 2023-12-15 23:37
Saat membuat draf genom, pembacaan DNA secara individu adalah yang pertama dirakit menjadi contigs , yang, menurut sifatnya perakitan , memiliki celah di antara mereka. Langkah selanjutnya adalah ke kemudian menjembatani kesenjangan antara ini selamat datang membuat perancah . Ini dapat dilakukan dengan menggunakan pemetaan optik atau pengurutan pasangan-pasangan.
Demikian pula, Anda mungkin bertanya, apa itu contigs dan scaffolds?
A perancah adalah bagian dari urutan genom yang direkonstruksi dari klon senapan seluruh genom yang diurutkan akhir. Perancah terdiri dari contigs dan kesenjangan. A tambahan adalah panjang urutan genom yang berdekatan di mana urutan basa diketahui dengan tingkat kepercayaan yang tinggi. Dalam beberapa kasus, perancah bisa tumpang tindih.
Juga, apa itu contigs dalam bioinformatika? A tambahan (dari bersebelahan) adalah satu set segmen DNA yang tumpang tindih yang bersama-sama mewakili wilayah konsensus DNA. tambahan dengan demikian dapat merujuk baik untuk urutan DNA yang tumpang tindih dan segmen fisik yang tumpang tindih (fragmen) yang terkandung dalam klon tergantung pada konteksnya.
Dalam hal ini, bagaimana contigs dirakit?
Himpunan urutan DNA yang tumpang tindih dari fragmen DNA dikenal sebagai a tambahan . tambahan pemetaan adalah proses di mana klon yang tumpang tindih berkumpul untuk urutan yang tumpang tindih. Ini melibatkan mengatur contigs dalam urutan dan orientasi. Klon contigs bisa otomatis berkumpul menggunakan urutan BAC-end mereka.
Mengapa contig penting?
tambahan perakitan adalah penting langkah dalam perakitan genom. Untuk pemetaan, klon yang tumpang tindih dirakit menjadi urutan yang tumpang tindih. Setiap fragmen dikloning dalam sebuah vektor dan diurutkan dari kedua ujungnya untuk menghasilkan panjang sekuens sekitar 600-700 bp. Urutan dari kedua ujung fragmen DNA disebut pasangan akhir.
Direkomendasikan:
Bagaimana cara menerjemahkan mRNA menjadi protein?
Seluruh proses ini disebut ekspresi gen. Dalam terjemahan, messenger RNA (mRNA) didekodekan di pusat decoding ribosom untuk menghasilkan rantai asam amino tertentu, atau polipeptida. Polipeptida kemudian terlipat menjadi protein aktif dan menjalankan fungsinya di dalam sel
Bagaimana DNA berubah menjadi mRNA?
Ia menggunakan DNA sebagai cetakan untuk membuat molekul RNA. RNA kemudian meninggalkan nukleus dan pergi ke ribosom di sitoplasma, di mana translasi terjadi. Ini adalah transfer instruksi genetik dalam DNA ke messenger RNA (mRNA). Selama transkripsi, untai mRNA dibuat yang melengkapi untai DNA
Apa itu protein perancah dan mengapa itu penting?
Dalam biologi, protein perancah adalah pengatur penting dari banyak jalur pensinyalan utama. Meskipun perancah tidak didefinisikan secara ketat dalam fungsinya, perancah diketahui berinteraksi dan/atau mengikat dengan banyak anggota jalur pensinyalan, mengikatnya menjadi kompleks
Apa arti perancah dalam biologi?
Diperbarui 8 Jan 2015. Perancah secara umum berarti struktur yang memberikan dukungan. Contoh scaffolding terbaik dalam biologi adalah perbaikan tulang yang patah (fraktur). Struktur sementara awal dibuat oleh tubuh yang disebut pro kalus. Pada pertumbuhan lebih lanjut ini terjadi
Apa yang membuat asam menjadi asam dan basa menjadi basa?
Asam adalah zat yang menyumbangkan ion hidrogen. Karena itu, ketika asam dilarutkan dalam air, keseimbangan antara ion hidrogen dan ion hidroksida bergeser. Jenis larutan ini bersifat asam. Basa adalah zat yang menerima ion hidrogen