Apa itu nicked DNA?
Apa itu nicked DNA?

Video: Apa itu nicked DNA?

Video: Apa itu nicked DNA?
Video: What is DNA and How Does it Work? 2024, November
Anonim

Torehan adalah diskontinuitas dalam untaian ganda DNA molekul di mana tidak ada ikatan fosfodiester antara nukleotida yang berdekatan dari satu untai biasanya melalui kerusakan atau aksi enzim. Torehan memungkinkan pelepasan torsi yang sangat dibutuhkan pada untaian selama DNA replikasi.

Demikian pula, Anda mungkin bertanya, apa itu nicked DNA. Bagaimana cara memperbaikinya?

Memperbaiki dari torehan Ligases serbaguna dan enzim di mana-mana yang bergabung dengan 3' hidroksil dan Ujung fosfat 5' ke membentuk ikatan fosfodiester, membuatnya penting dalam perbaikan DNA terpotong , dan akhirnya kesetiaan genom. Setiap situs nick membutuhkan 1 ATP atau 1 NAD+ ke kekuatan ligase memperbaiki.

apa itu DNA supercoiled nicked dan linear? Linearisasi DNA terjadi ketika DNA heliks dipotong di kedua untai di tempat yang sama. DNA linier umumnya bermigrasi antara tergores lingkaran dan superkoil formulir. Namun, itu juga dapat bermigrasi dengan jarak yang sama dengan tergores lingkaran - itu bermigrasi seperti yang diprediksi oleh panjang DNA (dibandingkan dengan penanda MW).

Kedua, apa itu DNA nicking?

A nicking enzim (atau nicking endonuklease) adalah enzim yang memotong satu untai untai ganda DNA pada urutan nukleotida pengenalan tertentu yang dikenal sebagai situs restriksi. Enzim tersebut menghidrolisis (memotong) hanya satu untai DNA dupleks, untuk menghasilkan DNA molekul yang "dipotong", bukan dibelah.

Mengapa plasmid DNA yang belum dipotong memiliki 3 pita?

Kapan DNA plasmid yang belum dipotong adalah diisolasi dan dijalankan pada gel agarosa, Anda adalah mungkin melihat 3 band . Ini adalah karena fakta bahwa lingkaran DNA mengambil beberapa konformasi makhluk yang paling melimpah: supercoiled, santai dan nicked. Jika jalur intisari Anda terlihat seperti Anda belum dipotong jalur lalu di sana adalah sesuatu yang salah!

Direkomendasikan: